Filippis söndagsskola är till för barn mellan 3 och 13 år. Söndagsskolan är mellan kl. 16.30 och 17.30, samtidigt som föräldrarna lyssnar på predikan eller föredrag. Söndagsskolan är indelad i tre olika åldersgrupper:
Undervisningen är avpassad för de olika åldersgrupperna. I de minsta grupperna får barnen sjunga och lära sig olika bibelberättelser. Det blir även tid för att rita och måla. I de större grupperna får barnen arbeta med olika uppgifter kring bibelberättelserna men även samtala om den kristna tron.